
La meilleure période pour partir à Raja Ampat s'étend d'octobre à avril, mais grâce à son climat tropical, l'archipel se visite toute l'année. Il fait autour de 31 °C en journée, et les températures baissent à 25 °C en soirée.
La mousson s'étend de mai à septembre, avec des pluies tropicales peu intenses. Attention à la saison des vents et une mer agitée entre mi-juin et mi-septembre.